- Alligator cowiei Smith In Hewitt, 1937
- Crocodilus chamses Bory De Saint Vincent, 1824
- Crocodilus complanatus Geoffroy, 1827
- Crocodilus hexaphractos (Nomen Nudum), 1886
- Crocodilus lacunosus Geoffroy, 1827
- Crocodilus madagascariensis Grandidier, 1872
- Crocodilus marginatus Geoffroy, 1827
- Crocodilus multiscutatus, 1826
- Crocodilus octophractus, 1831
- Crocodilus vulgaris Cuvier, 1807
- Crocodilus vulgaris var. madagascariensis Boettger, 1877
- Crocodylus madagascariensis Grandidier, 1872
- Crocodylus worthingtoni Deraniyagala